Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna3O35344 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna3O35344 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms