Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd2O35245 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms