Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad6O35182 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad6O35182 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms