Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pitx3O35160 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms