Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc23O35125 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc23O35125 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc23O35125 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc23O35125 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc23O35125 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc23O35125 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc23O35125 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc23O35125 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms