Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scarb2O35114 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scarb2O35114 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Scarb2O35114 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scarb2O35114 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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