Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hps1O08983 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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