Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec22bO08547 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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