Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3278L7N2D2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3278L7N2D2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms