Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700122O11RikJ3QPW6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms