Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5849J3QPE5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5849J3QPE5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms