Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm2035J3QP87 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms