Protein–RNA interactions for Protein: J3QP72

Gm21738, Predicted gene, 21738, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21738J3QP72 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm21738J3QP72 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21738J3QP72 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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