Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm5294J3QP53 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm5294J3QP53 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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