Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm10428J3QNV7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gm10428J3QNV7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms