Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc180J3QNE4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc180J3QNE4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms