Protein–RNA interactions for Protein: J3QN84

Gm21812, Predicted gene, 21812, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21812J3QN84 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21812J3QN84 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm21812J3QN84 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21812J3QN84 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms