Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calhm3J3QMI4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms