Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms