Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf4bG5E8Z2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf4bG5E8Z2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms