Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pabpc4lG5E8X2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pabpc4lG5E8X2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms