Protein–RNA interactions for Protein: G5E8K1

2610028H24Rik, RIKEN cDNA 2610028H24, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610028H24RikG5E8K1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
2610028H24RikG5E8K1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
2610028H24RikG5E8K1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms