Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms