Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms