Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r39G3UWE6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms