Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r76F8VQ63 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r76F8VQ63 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms