Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh9F8VPK8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcdh9F8VPK8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms