Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3371F7CQW8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3371F7CQW8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms