Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SmgcF6VRN1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SmgcF6VRN1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms