Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Atf6F6VAN0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf6F6VAN0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf6F6VAN0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf6F6VAN0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf6F6VAN0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf6F6VAN0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6F6VAN0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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