Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20671F6TVX7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm20671F6TVX7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20671F6TVX7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms