Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TrdnE9Q9K5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms