Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp31E9Q6Y8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp31E9Q6Y8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms