Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6P5

Ttc7b, Tetratricopeptide repeat protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc7bE9Q6P5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc7bE9Q6P5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms