Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tarbp1E9Q368 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tarbp1E9Q368 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms