Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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