Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt78E9Q0F0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms