Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3095E9Q058 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms