Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc1E9Q043 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc1E9Q043 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms