Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ddx60E9PZQ1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddx60E9PZQ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms