Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scaf11E9PZM7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scaf11E9PZM7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms