Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd1E9PZ26 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms