Protein–RNA interactions for Protein: E9PV87

Talpid3, Protein TALPID3, mousemouse

Predictions only

Length 1,520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Talpid3E9PV87 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Talpid3E9PV87 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Talpid3E9PV87 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Talpid3E9PV87 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Talpid3E9PV87 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Talpid3E9PV87 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Talpid3E9PV87 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Talpid3E9PV87 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Talpid3E9PV87 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Talpid3E9PV87 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms