Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
BC035044E0CXF8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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BC035044E0CXF8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BC035044E0CXF8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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BC035044E0CXF8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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BC035044E0CXF8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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BC035044E0CXF8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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BC035044E0CXF8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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BC035044E0CXF8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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BC035044E0CXF8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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