Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms