Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms