Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm6685D3YYP3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm6685D3YYP3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms