Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd1D3YXK1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms