Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
9230113P08RikD3YWX3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms