Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc13D3YV10 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc13D3YV10 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms